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選擇DNA提取試劑盒時(shí),重要的變量可能是你所使用的生物體

點(diǎn)擊次數(shù):1921 更新時(shí)間:2022-03-18
  實(shí)驗(yàn)室工作中,經(jīng)常會(huì)需要用到純化的DNA,這時(shí)我們通常需要使用一個(gè)DNA提取試劑盒對(duì)目的DNA進(jìn)行分離純化。市面上有很多類型的提取試劑盒,當(dāng)使用不太熟悉的樣本類型時(shí),選擇合適的盒子是尤為關(guān)鍵的。
 

 

  DNA提取試劑盒組分:
  目前大多數(shù)DNA提取試劑盒遵循相同的基本步驟:裂解,柱純化,洗滌雜質(zhì),柱洗脫。然而,不同的盒子在完成每個(gè)步驟的方式上有很大的不同。
 
  使用的樣本類型:
  不同的DNA來(lái)源有不同的試劑盒,從實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的細(xì)胞,到臨床樣本,土壤樣本,甚至指紋,也有許多專門用于某些應(yīng)用的試劑盒。例如,土壤中的腐殖酸或血液中的血紅蛋白會(huì)污染純化的DNA,從而干擾下游的DNA實(shí)驗(yàn)。當(dāng)然,也有一些試劑盒會(huì)在進(jìn)行純化步驟之前專門去除這些組分。如果想從PCR或瓊脂糖凝膠中純化DNA,有許多方法可以提高瓊脂糖凝膠純化的回收率。
 
  在選擇DNA提取試劑盒時(shí),重要的變量可能是你所使用的生物體。
  1、細(xì)菌:許多試劑盒都有用于細(xì)菌DNA分離的不同成分,這些試劑盒之間的主要區(qū)別在于細(xì)胞是如何被分解的,因?yàn)橛行┘?xì)菌比其他細(xì)菌更更有挑戰(zhàn)性。例如,形成生物膜的細(xì)菌可能比傳統(tǒng)的基于去垢劑的方法需要更強(qiáng)的裂解技術(shù)。
  2、動(dòng)物組織:用于動(dòng)物組織DNA分離的試劑盒通常具有更溫和的裂解技術(shù),因?yàn)榇蠖鄶?shù)動(dòng)物細(xì)胞不像細(xì)菌細(xì)胞那樣有細(xì)胞壁。然而,動(dòng)物組織DNA提取的挑戰(zhàn)往往在于選擇合適的組織勻漿方法。此外,許多動(dòng)物DNA純化試劑盒不使用苯酚/氯仿萃取或乙醇作為沉淀步驟,以減少破壞DNA的風(fēng)險(xiǎn)。
  3、植物:當(dāng)涉及到植物DNA分離時(shí),必須考慮到其他一些因素,需要注意污染物的去除。植物在純化過(guò)程中通常含有未分離的糖,因此,洗滌劑選擇性地與DNA結(jié)合并從溶液中析出,通常是先將洗滌劑溶解在高濃度的鹽溶液中,然后提取DNA。
  4、血液:由于技術(shù)上的許多最新進(jìn)展,血液DNA分離試劑盒中有多種裂解技術(shù)和提取方法可供選擇。從血液中分離出的DNA將在很大程度上決定你使用的裂解和提取的類型。無(wú)論應(yīng)用是什么,一定要選擇一種能夠提供純凈、完整、雙鏈和濃縮DNA的試劑盒,以獲得最佳效果。
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